85 мячей:

Жо(ЦСКА)

50 мячей:

Павлюченко(Спартак)

39 мячей:

Кержаков(Зенит)

33 мяча:

Перез(Ростов)

32 мяча:

Каньенда(Ростов)

28 мячей:

Медведев(Крылья Советов)
Аршавин(Зенит)

27 мячей:

Оспешинский(Луч-Энергия)

26 мячей:

Архипов(Химки)

24 мяча:

Гьян(Сатурн)
Рикардо(Кубань)

23 мяча:

Сычёв,О'Коннор(оба Локомотив)

21 мяч:

Быстров(Спартак)

18 мячей:

Бесчасных(Химки)
Луценко(Торпедо)

17 мячей:

Квинси(Спартак)

15 мячей:

Вагнер Лав,Олич(оба ЦСКА)
Ральф(Рубин)

14 мячей:

Ерёменко(Сатурн)
Стрелков(Кубань)

13 мячей:

Бракамонте(Москва)

12 мячей:

Пехна(Торпедо)
Кириченко(Москва)

10 мячей:

Моцарт(Спартак)

9 мячей:

Погребняк(Томь)

8 мячей:

Топич,Бобёр,Виноградов(все Крылья Советов)
Тихонов(Химки)
Аджинджал(Луч-Энергия)
Калиниченко(Спартак)

7 мячей:

Белецкий(Ростов)
Муджири(Крылья Советов)
Лоськов(Локомотив)

6 мячей:

Осинов,Лайзанс(оба Ростов)
Красич(ЦСКА)
Будылин(Торпедо)
Савин(Амкар)
Баррьентос(Москва)
Риксен(Зенит)

5 мячей:

Данни,Дерлей(оба Динамо)
Карвальо(ЦСКА)
Семак(Москва)
Шоава(Крылья Советов)
Денисов(Зенит)
Домингес(Рубин)

4 мяча:

Волков(Амкар)
Пошкус(Динамо)
Иванов(Луч-Энергия)
Иванов(Кубань)
Сибайя(Рубин)
Шишкин(Спартак)

3 мяча:

Радимов,Ширл(оба Зенит)
Волков(Торпедо)
Кисилёв(Томь)
Зуев(Кубань)
Обжера(Сатурн)
Гусин(Крылья Советов)
Базаев(Луч-Энергия)
Титов(Спартак)

2 мяча:

Мор,Лебеденков(оба Химки)
Тчуйсе,Адамов(оба Москва)
Лобов(Луч-Энергия)
Чеснаускис(Сатурн)
Янбаев(Кубань)
Бенашур(Рубин)

1 мяч:

Шкртел,Хаген,Текке,Спивак,Анюков(все Зенит)
Иранек,Дзюба,Штранцль,Бояринцев,Жедер(все Спартак)
Мамаев,Зырянов,Кущ(все Торпедо)
Сабитов,Вукчевич,Половинчук(все Сатурн)
Семшов,Ромащенко,Хохлов(все Динамо)
Калачёв,Орлов(оба Ростов)
Дроздов,Йованович(оба Химки)
Янотовский,Кисилёв(оба Томь)
Саркисян,Зияти(оба Амкар)
Мелешин,Горавски(оба Москва
Спахич,Билялетдинов(оба Локомотив)
Байрамов,Ялланд(оба Рубин)
Антонов(Кубань)

Автоголы:

2 мяча:

Чеснаускис(Сатурн)

1 мяч: